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位图索引bitmap(三):位图索引技术集合FastBit

数据结构算法 water 2967℃ 0评论

本节所介绍的FastBit是位图索引技术的集大成者,是一系列高级位图索引技术的集合,该项目最初设计目标是为美国国家高能物理实验提供支撑。
在FastBit中,两个核心创新点分别是:

字对齐混合压缩编码WAH,根据官方实验数据显示,其在高能物理实验中的索引性能是传统数据库的10倍以上,如图2.7所示;

多层次(两层)位图编码方式,包括EE、RE和IE,与传统E1、BN编码的实验性能对比如图2.8所示。

目前,FastBit也成功应用于多种开源项目中,其中包括联机实时分析引擎Druid,其将FastBit中的高级索引技术与Hadoop的分布式文件系统HDFS结合起来。下面三节的主要工作就是介绍FastBit中核心创新点之一的WAH算法,和其改进算法Concise以及另辟蹊径的一种高级位图索引技术Roaring Bitmap。

1 WAH
WAH算法的核心在于两点:Word-Aligned和Hybrid。

Word-Aligned充分利用了现代CPU的特性,操作Word要比Byte效率高,所以WAH按照字对齐的方式对bitmap进行分组压缩;

Hybrid针对bitmap中既存在大量连续的“0”或“1”序列,又存在“0”“1”混合序列的情况,对这两种情况采用不同的压缩编码策略。

我们将Word分成两类:literal words和fill words,其中literal words用于“0”“1”混合序列,置最高位bit为0,剩余bits直接存储混合序列;fill words用于大量连续的“0”或“1”序列,置最高位bit为1,全“0”序列置次高位bit为0,全“1”序列置次高位bit为1,剩余bits存储该序列中“0”或“1”的个数,高位不足则用“0”补齐。图2.9给出了WAH算法的具体过程,下面我们结合图例进行介绍。

2 Concise Bitmap
Concise算法,全称叫做“Compressed‘n’ Composable Integer set”,是WAH算法的改进型。从上一节中我们可以看出,对于fill words,除去最高位和次高位,剩余的30bits最大可以表示2^30-1个连续的全“0”或全“1”序列,但是在实际使用场景中并不会出现,所以必然还有优化的空间。那么Concise算法就是高效压缩fill words中低n bits的改进型的WAH算法,或者说Concise算法解决如何压缩一个可组合的整数集合,或者可以是认为如何压缩一个稀疏的bitmap这一类问题。在实验中,Concise算法的压缩性能比WAH提高50%左右。

在Concise算法中,依然存在literal words和fill words的概念。其中,对于literal words,压缩策略与WAH基本一致,不过有一点差别,Concise置最高位为“1”来表示literal words,“0”表示fill words,如图2.10所示;对于fill words,除了最高位置“0”,次高位与WAH一致外,紧接着的5bits称为“Position bits”,代表了反转的位置(the position of a “flipped” bit),表示在第一个31-bitsgroup中从第几位开始进行0、1反转。举例说明:

若Position bits = 0 (用二进制00000表示),代表该word是一个纯粹的fill word,语义与WAH一致;

若Position bits = n (0, 32) (用五位二进制表示),代表此fill word中第一个31-bitsgroup从第n位开始0、1反转;
而剩余的25bits表示除第一个31-bitsgroup外,该fill word还存放多少个连续的31-bits group,语义与fill words一致。我们可以看出,一个Word的最大的范围是31 + 2^25 * 31 = 1040187423 bit。

图2.11给出了一个由6个words组成的Concise算法样例,在Concise算法中,我们把bitmap看作是一个整数集合,也就是说如果此bitmap是一个literal word,那么位数则代表整数的个数,固定为31个;如果此bitmap是一个fill word,那么整数的个数为Count(31-bits group) * 31。下面我们就结合图例来理解Concise算法。

Word#0 是literal word,除去最高位,剩余31bit可以表示[0,30]这31个整数。

Word #1 是fill word,其中次高位为1,表示全“1”序列,Position bits为00000,表示此fill word语义与WAH一致,后25bits为1,表示包含2个31-bits group,第一个31-bits group表示[31,61]这31个整数,第二个31-bits group表示[62,92]这31个整数,即Word#1表示[31,92]这62个整数。

Word#2是fill word,次高位为0,表示全“0”序列,Position bits为00001,表示从第一个31-bits group的最低位开始0->1反转,后25bits为11101,表示除第一个31-bits group外,还有29个31-bits group,最大可以表示93(start) + 31 + 29 * 31 – 1 = 1022,即Word #2表示[93, 1022]这个区间内的整数。

Word #3 是literal word,包含31个整数,表示[1023, 1053]这个区间内的整数。

Word#4 是fill word,次高位为0,表示全“0”序列,Position bits为00000,表示该fill word的语义与WAH一致,后25bits为33554397(十进制表示),表示共有33554398个31-bits group,最大可以表示1054 + 31 + 33554397 * 31 – 1 = 1040187391,即Word #4表示[1054, 1040187391]这个区间内的整数。

Word#5 是literal word,包含31个整数,表示[1 040 187 392, 1 040 187 422]这个区间内的整数。

3 Roaring Bitmap
上两节介绍的WAH和Concise压缩算法都是基于RLE原理,而Roaring bitmap则另辟蹊径,实验表明Roaring bitmap的压缩性能比RLE类更高。目前已知的使用Roaring bitmap的开源项目有Apache Spark、Apache Lucene和Druid.io。

Roaring Bitmap的主要思想是将32bit的整数分割成2^16个数据块,所有数据块共享相同的高16bit,低16bit则使用专门的容器来保存。容器可分为以下两种:

当一个数据块中的整数个数不超过4k时,我们认为是一个稀疏数据块,使用16bit/整数的有序数组容器(ArrayContainer)进行保存。

当一个数据块超过4096个整数时,我们认为是一个密集数据块,使用2^16bit的bitmap容器进行保存。

其中,阈值4k保证了每个整数不超过16bit,其中数组容器是固定bit(16 bit/整数),而bitmap容器中每个整数不超过2^16 / 4k = 16 bit。那么,为什么选择4k这个阈值呢?因为根据上述公式,小于4k时,bitmap容器将会大于16bit/整数,大于4k时,数组容器大小会超过2^16 bit。总之,数据块基数较小时,使用数组更省空间,基数较大时,使用bitmap更省空间。

下面,我们简单介绍下基于Roaring bitmap的相关操作:

基数计算
每种容器(位图容器、数组容器)都使用一个计数器来记录它的基数,所以最多只需要累加2^16个计数器就可以完成。

数据查找
判断一个32bit的整数x是否存在,我们首先使用二分查找搜索x/2^16关联的容器。如果访问到的是数组容器,那么我们将继续迭代二分查找;如果访问到的是bitmap容器,那么我们就访问第x%2^16个bit,“0”表示不存在,“1”表示存在。

数据插入与删除
对于插入或者删除一个数据,我们首先需要找到对应的容器,当对象是一个数组容器时,我们使用二分查找在线性时间内插入或删除数据;当对象是一个bitmap容器时,我们设置对应bit的值并更新计数器。当删除一个整数时,bitmap容器的基数可能会减少到4k,退化为一个数组容器。当增加一个整数,一个整数容器的基数可能会超过4k,而变成一个bitmap容器。当上述两种情况发生时,Roaring bitmap会创建新的容器,更新计数器等并丢弃旧容器。
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